病人已有甲状腺功能减低或明显的亚临床甲减时，必须用甲状腺激素替代治疗。治疗的目标是将血清TSH和甲状腺激素水平恢复到正常范围。一般从每天25～50μg开始，每1～2周增加25μg，直至达到完全替代目标。有心脏病者宜每天12.5～25μg开始，每2周增加12.5~25μg，以免诱发和加重心脏病病情。
理想的L一T4服药方法是早晨空腹服用1次。与其他药物的服用间隔应当在4h以上，因为有些药物和食物会影响它的吸收和代谢。治疗初期，每间隔4～6周测定相关激素指标。然后根据检查结果调整剂量，直至达到治疗目标。治疗达标后，需要每6～12个月复查1次有关激素指标。
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